Родопската област е географски свързана с Тракия. Граничи с България (област Кърджали) на север, с област Ксанти на запад, с област Марица на изток и Тракийско море на юг, като бреговата линия е приблизително 58 км. Северната част на областта обхваща източната част на Родопите, откъдето е и кръстена.

С присъединяването на Западна Тракия към Гърция (1920 г.) възниква и въпросът за административната асимилация. Накрая, със законодателен указ от 21 ноември 1923 г. Тракия е разделена на две префектури, Родопи и Марица; първата включва територията на по-късната префектура Ксанти.

Родопи са създадени като префектура през 1930 г., когато бившата префектура Тракия е разделена на префектурите Родопи и Марица. През 1944 г. префектура Ксанти е образувана от западната част на префектура Родопи. От 90-те години на миналия век Родопи си сътрудничат с Марица в рамките на Родопско-Маришка суперпрефектура.

Като част от реформата на правителството на Каликрат от 2011 г., префектурата е преобразувана в териториална единица в рамките на региона Източна Македония и Тракия, без никакви промени в границите ѝ.