Beğendik kasabasının tarihi hakkında küçük bir yerleşim yeri olduğu için yazılı bir belge veya kaynak bulunmamaktadır. Bulunan kaynaklarda da Keşan hakkında bilgiler mevcuttur. Fakat bu kaynaklarda Beğendik'in sadece adı geçmektedir.

Rivayete göre, Lala Şahin Paşa Balkanları fethettiği zaman Keşan'a uğradığında Beğendik'e de gelir. Keşan istikametinden Beğendik'e gelişinde sol tarafta bulunan manastır yanında konaklar. Lala Şahin Paşa köye bakarak, 'Burayı çok beğendim. Buranın adı Beğendik olsun.” der. İşte o günden sonra burasının adı Beğendik olarak kalır.

Beğendik köyü 1900'lü yıllarda bir Rum köyü idi. Eskiden burada yaşayan Rumların anlattıklarına göre buraya Rumca kahraman veya delikanlı ismini vermişler. Birinci dünya savaşından sonra belde halkı Yunanistan ve Bulgaristan'dan buraya göç etmişler ve Rumları buradan çıkarmışlardır. Şu an Beğendik'in tamamı Türk ve Müslüman'dır.

Beğendik, Cumhuriyetin ilanıyla birlikte muhtarla idare edilmiştir. 1969 yılında belediye olmuş ve üç büyük mahalleye ayrılmıştır. Beğendik, Keşan'ın ilk belediyelik olan kasabasıdır.